دانشگاه آزاد اسلامی با عنایت به نوع سیستم آموزشی و اداری منحصر به فرد الزاماً دارای سیستم مدیریتی بسیار پیچیده و موثرتری نسبت به سایر مراكز می‌باشد. نیاز روزافزون به ساخت و ایجاد فضاهای آموزشی و جذب نیروی متخصص به عنوان مهمترین عوامل توسعه هر موسسه آموزشی، تلاش بسیاری از طرف مسئولین و علی‌الخصوص رئیس واحدهای دانشگاه می‌طلبد. همچنین سیستم مالی دانشگاه آزاد اسلامی بلحاظ اینكه هر واحد تقریبا بایستی بصورت مستقل منابع مالی را جذب و رأساً در چارچوب آئین‌نامه‌های سازمان مركزی و با مسئولیت مستقیم ریاست واحد هزینه نماید، باعث گردیده نقش رئیس واحد در این دانشگاه برجسته‌تر گردد.

   از سایر وظایف رئیس واحد تهیه و تدوین بودجه در چارچوب برنامه‌های كوتاه مدت، میان مدت و بلند مدت تدوین شده از طرف سازمان مركزی دانشگاه آزاد اسلامی و نظارت مستقیم بر اجرای بودجه می‌باشد كه بلحاظ محدود بودن منابع درآمدی بایستی دقت بسیار بالایی در این بخش صورت گیرد. امور فوق و سایر فعالیت‌های واحد توسط معاونت‌ها و حوزه‌های ذیل و زیر نظر ریاست واحد صورت می پذیرد:

     1) معاونت آموزشی
2) معاونت پژوهشی
3) معاونت اداری و مالی
4) معاونت دانشجوئی
5) معاونت عمران
6) حوزه حراست
7) حوزه دفتر فرهنگی